Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FOXF1Q12946 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FOXF1Q12946 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FOXF1Q12946 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FOXF1Q12946 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FOXF1Q12946 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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