Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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TFF3Q07654 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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TFF3Q07654 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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TFF3Q07654 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TFF3Q07654 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TFF3Q07654 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TFF3Q07654 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TFF3Q07654 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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