Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX16P57768 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX16P57768 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX16P57768 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX16P57768 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX16P57768 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX16P57768 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX16P57768 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX16P57768 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX16P57768 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX16P57768 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX16P57768 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX16P57768 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX16P57768 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX16P57768 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX16P57768 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX16P57768 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms