Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLE2P56282 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLE2P56282 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLE2P56282 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLE2P56282 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLE2P56282 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
POLE2P56282 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLE2P56282 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLE2P56282 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLE2P56282 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLE2P56282 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms