Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMK2P53671 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIMK2P53671 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms