Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD8P48556 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms