Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM5CP41229 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms