Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRMP28827 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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PTPRMP28827 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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PTPRMP28827 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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PTPRMP28827 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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PTPRMP28827 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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