Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms