Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA1P17302 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA1P17302 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA1P17302 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA1P17302 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA1P17302 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA1P17302 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA1P17302 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA1P17302 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms