Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF3O95398 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms