Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSI1O43347 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSI1O43347 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSI1O43347 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSI1O43347 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSI1O43347 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSI1O43347 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSI1O43347 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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MSI1O43347 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSI1O43347 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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