Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNMO15061 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNMO15061 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNMO15061 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNMO15061 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNMO15061 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNMO15061 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms