Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USP9YO00507 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms