Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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RABGEF1Q9UJ41 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RABGEF1Q9UJ41 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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