Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APEX2Q9UBZ4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms