Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCHIP1Q9P0W5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCHIP1Q9P0W5 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms