Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HACD3Q9P035 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms