Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CISHQ9NSE2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms