Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPHK2Q9NRA0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPHK2Q9NRA0 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms