Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms