Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUSC1Q9BVN2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms