Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIRT1Q96EB6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms