Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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CLIP4Q8N3C7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLIP4Q8N3C7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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