Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPAP2Q8IXW5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms