Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CATSPER4Q7RTX7 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms