Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms