Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KNOP1Q1ED39 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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