Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FSCN1Q16658 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms