Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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DDB1Q16531 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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DDB1Q16531 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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DDB1Q16531 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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DDB1Q16531 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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DDB1Q16531 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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DDB1Q16531 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DDB1Q16531 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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