Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SEC23BQ15437 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms