Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCLAFQ15004 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms