Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CDH18Q13634 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CDH18Q13634 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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