Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SKP2Q13309 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms