Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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