Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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