Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms