Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALD1Q05682 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms