Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms