Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK3Q00526 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK3Q00526 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms