Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC13P55735 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC13P55735 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC13P55735 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC13P55735 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC13P55735 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC13P55735 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC13P55735 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC13P55735 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC13P55735 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms