Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSBP45954 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms