Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms