Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTSSP25774 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTSSP25774 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CTSSP25774 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSSP25774 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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