Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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PKHD1P08F94 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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PKHD1P08F94 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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PKHD1P08F94 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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PKHD1P08F94 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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PKHD1P08F94 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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PKHD1P08F94 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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PKHD1P08F94 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
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