Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POP4O95707 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POP4O95707 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POP4O95707 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms