Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SEC24DO94855 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SEC24DO94855 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SEC24DO94855 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC24DO94855 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SEC24DO94855 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SEC24DO94855 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SEC24DO94855 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SEC24DO94855 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SEC24DO94855 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SEC24DO94855 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SEC24DO94855 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SEC24DO94855 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC24DO94855 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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