Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBDO15205 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBDO15205 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBDO15205 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBDO15205 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBDO15205 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBDO15205 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
UBDO15205 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBDO15205 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBDO15205 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBDO15205 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms