Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SETD1BQ9UPS6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms