Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSFQ9UBX1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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